La Red Natura 2000 es el conjunto de áreas de conservación de la biodiversidad de la Unión Europea que tiene como finalidad preservar todos los tipos de hábitats y especies de flora y fauna silvestre de interés comunitario. En La Rioja hay declarados 6 espacios protegidos o Zonas de Especial Conservación (ZEC) Natura 2000, que a su vez también son Zonas de Especial Conservación para las Aves (ZEPA), y ocupan 167.541 hectáreas, más del 33% de la superficie de la región. Esto sitúa a La Rioja entre las comunidades españolas que mayor proporción de territorio aportan a Red Natura 2000.
Superficie protegida por Red Natura: